日本入境指纹保留多久？
在留卡上的印章，是永久有效，这个章不是在你离境的时候按的，是在你申请在留资格认定证明书（就是确定你能留下来打工或者留学的证明）的时候，由日本出入境管理机关在你护照上加盖的，有了这个才能在国外买到前往日本的机票。这个章一盖上，你拿在留资格认定证明书和护照就可以直接去海关了，不用办其他手续！！ 办理签证时候的指纹，是在留卡下发后，你再去领事馆办理签注或者换签的时候录得，这个指纹不会上传到任何系统里，相当于留个案底，对以后没有任何影响。
但如果是非法滞留被逮捕并拘留的，那后果就严重了，日本海关会记录在案，并通报给国内，以后想再出国可就难了，甚至会有可能被禁止入境。 建议楼主好好看看自己的在留卡，如果是在留卡上盖有“入国時の指紋”的印章，那就没关系；若是在留卡上无此印章、而在护照上有贴有带有“出入国証明書（ビザ）”的贴纸，就要注意，可能是在申请办理在留卡时录入的指纹，这种一般称作为“短期滞在（短暂停留)” 的签证，这类签证是在你入境日本时验看护照+签证，然后通过录入你的指纹来完成审核的。
通常这种15天以内的短期签证是不让个人赴日的，必须是港澳/台湾地区的旅游团体或韩国旅行团一并被带到日本参加旅游项目，期间有导游陪同。所以如果你看到你在机场被带到某家旅行社办手续，那就是这种情况啦~！