入籍日本孩子可以来日本吗？
题主的表述有些混乱，可能意思是想咨询“以子女名义申请日本签证的问题”吧？ 先明确一点：无论父母还是孩子，任何人以任何目的入境日本都必须持有有效护照和合理的签证。这里提到的签证是总称，具体指代的签证类型要根据实际情况判断。 假设父母已加入日本国籍：
1.如果父母以旅游为目的出国（除日本以外的地方）然后在回国前2个月通过申请方式取得“永住许可”并成功移民日本的话。那么再入境日本时，该父母及子女是以日本人身份持有的签证（也就是所谓的“定居证”或“居民票”)。
2.如果父母以留学、工作等方式长期滞留在日本，并且在离境前2个月内申请并取得上述“永住许可”且成功移民日本的话。那么再入境日本时是以上述理由申请的签证。
3.如果父或母其中一方是日本国籍，而另一方不是的情况下。原则上是不允许以夫妻双方同居为目的申请长一点的停留期的。但如果有充分的证明文件证明双方以夫妻名义共同生活并且经济上也是独立的话，则除外。这种情况下，再次入境日本时的签证与上例相同。 而若是以子女名义申请签证的情况就比较复杂了。因为不知道题主说的是以未成年子女办理留学签证去日本读语言学校、大学等情况，还是以成年子女办探亲或者其他目的签证的情况。
如果是前者，原则上是不以父母的国籍为判断基准的。只要条件符合，即使父母其中一方或者几方是中国国籍也可以申请。毕竟日本是一个单一国籍制度国家，只要是日本的合法公民，不管原来是什么国籍，都可以称为“日本国籍人”。所以这个时候孩子是以日本国籍人的身份申请签证。
但是！请注意！虽然理论上是这样的，但是实际操作中因为中国国籍比较特殊，所以是以其他理由先行入境日本，随后再申请签证的过程居多。这是因为中国在签证方面的监管较为严格，一旦有了不良记录可能会对今后在中国境内的生活带来麻烦。 所以这样的做法其实是保留了中国的国籍作为最后底牌的。
另外有一点需要说明的是，这种以子女的名义申请的签证是有可能拒签的。不过，如果父母已经有日本国籍，再申请签证的时候，由于不存在“避税”“逃避境外务工限制”等不合理嫌疑，所以被驳回的可能性不大。而如果父母没有日本国籍而是以其它理由申请签证的话，那就得视具体情况而定。